Один из наиболее ярких и талантливых командиров. Родился 5 марта 1965 года в городе Степанакерте, где в 1982 г. окончил среднюю школу, в 1983-85 гг. проходил службу в рядах Советской армии. 
С началом Карабахского движения присоединился к освободительной борьбе. Возглавил небольшой отряд. В июне 1991г. арестован в Степанакерте, в декабре Само обменяли и он вновь присоеденился к освободительной борьбе.
Самвел Бабаян участвовал в боях на самых трудных участках. Не отягощенный академичискми военными знаниями принимал смелые и неординарные решения. Несмотря на свою молодость он уже в 1992 назначается на командные должности, становится командующим армией ( 1993), а в 1995г. Министром Обороны НКР. 
По словам Аркадия Тер-Тадевосяна ( «Коммандос») «Само – командир от Бога».
За исключительные заслуги в организации защиты Нагорно-Карабахской Республики, проявленное мужество и личную отвагу Самвел Бабаян был удостоин высшего звания НКР - "Герой Арцаха”, с вручением ордена "Золотой Орел”. 
Бабаян вернул эти награды в 1999г. в знак протеста.
В 1999г. освобождается от должности министра обороны и командующего армией обороны НКР.
В 2000г. заключен под стражу по обвинению в организации покушения на Президента НКР Аркадия Гукасяна, был приговорен к 14 годам заключения. В 2004г. помилован Президентом Гукасяном. 
Ныне возглавляет партию "Дашинк".